BD Rhapsody TM 單細(xì)胞分析系統(tǒng)

     平行分析數(shù)千個(gè)單細(xì)胞內(nèi)數(shù)百個(gè)基因的表達(dá)水平

克服 PCR  偏差 – BD  分子 標(biāo)簽

       當(dāng)對(duì)序列讀取進(jìn)行計(jì)數(shù)時(shí)，PCR 擴(kuò)增偏差可導(dǎo)致基因定量不準(zhǔn)確。BD 的分子標(biāo)簽ZG技術(shù)為單個(gè)細(xì)胞的單個(gè)基因分配了獨(dú)特的分子索引，也稱為“分子條形碼”。實(shí)驗(yàn)者可借此克服擴(kuò)增偏差，更準(zhǔn)確地計(jì)算轉(zhuǎn)錄水平。

為您的實(shí)驗(yàn)定制工作流程

      對(duì)于不同用戶和實(shí)驗(yàn)，單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD 儀器選項(xiàng)可以根據(jù)具體需求進(jìn)行配置。BD FACS 分選機(jī)（如 BD FACSMelody?）是 BD Rhapsody 系統(tǒng)上游樣本富集的良好選擇。BD Rhapsody掃描儀提供自動(dòng)化細(xì)胞計(jì)數(shù)和細(xì)胞樣本活性測(cè)試，幫助用戶制備適用于卡式芯片單細(xì)胞捕獲的**濃度的樣本。掃描儀提供了卡式芯片上微球捕獲細(xì)胞的計(jì)數(shù)。BD Rhapsody 上樣臺(tái)輕巧便攜，可在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)輕松移動(dòng)。同樣還提供生物信息
學(xué)途徑和可視化工具。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具，即使沒(méi)有經(jīng)驗(yàn)的用戶也可分析和理解單細(xì)胞數(shù)據(jù)。

更有效的測(cè)序可以更低的成本 實(shí)現(xiàn) 更高的 通量

      由于與高通量實(shí)驗(yàn)方法相關(guān)的測(cè)序成本，單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴。BD Rhapsody 單細(xì)胞分析系統(tǒng)設(shè)計(jì)有多個(gè)功能，可以更有效地利用測(cè)序來(lái)降低實(shí)驗(yàn)成本。

●  靶向測(cè)定 - 由于檢測(cè)靈敏度的提高，特定的基因組合方法可使用少量的時(shí)間和成本，幫助產(chǎn)生類似于全轉(zhuǎn)錄組分析（Whole Transcriptome Analysis，WTA）測(cè)定的結(jié)果。這種方法還提高了 UMI 計(jì)數(shù)效率，從而極大程度的節(jié)省了實(shí)驗(yàn)時(shí)間和成本。

●  儲(chǔ)存 - 從樣本中得到的完整 cDNA 可在磁性微球上穩(wěn)定存儲(chǔ)，允許將珍貴樣本保存長(zhǎng)達(dá) 16 周。這可使用戶在時(shí)間允許的情況下靈活地對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)序，并通過(guò)對(duì)儲(chǔ)存的微球池進(jìn)行等分或分樣來(lái)實(shí)現(xiàn)同一樣本的多個(gè)測(cè)定。

●  分樣—在磁性微球上儲(chǔ)存的 cDNA A 可以分成一個(gè)或多個(gè)等分試樣，并使用定制或預(yù)先設(shè)計(jì)的組合（panel）進(jìn)行擴(kuò)增。通過(guò)提供對(duì)部分樣本進(jìn)行測(cè)序的選項(xiàng)和對(duì)樣本不同組合（panel）進(jìn)行測(cè)試的靈活性，分樣可降低成本。

使單細(xì)胞測(cè)序效率更高

        靶向方法對(duì)單細(xì)胞分析的益處通過(guò)使用競(jìng)爭(zhēng)產(chǎn)品的WTA 測(cè)定和 BD Rhapsody 免疫反應(yīng)組合（panel）（人）在相似的測(cè)序深度下對(duì)外周血單核細(xì)胞（PBMC）進(jìn)行表達(dá)譜分析來(lái)證明。雖然兩種測(cè)定方法的 t-SNE 表達(dá)譜分析都顯示了已知 PMBC 細(xì)胞類型的聚類結(jié)果，靶向組合（panel）顯示了比 WTA 更高的靈敏度（讀數(shù)/細(xì)胞）和 UMI 計(jì)數(shù)效率。BD Rhapsody 測(cè)定實(shí)現(xiàn)了與競(jìng)品 WTA 測(cè)定類似的聚類性能，而測(cè)序讀數(shù)降低了近 10 倍（靶向讀數(shù) 2k vs. WTA 讀數(shù) 20k）。與使用 WTA 方法不同，靶向組合（panel）避免了對(duì)多個(gè)高表達(dá)基因的測(cè)序如核糖體蛋白或低表達(dá)變異性，從而提高測(cè)定效率。

      混合微球的測(cè)試儲(chǔ)存（參見圖 6），從含有稀少轉(zhuǎn)移性乳腺癌細(xì)胞的淋巴結(jié)所得的 1，000 個(gè)細(xì)胞的兩個(gè)分樣使用BD Rhapsody Onco-BC 靶向組合（panel）進(jìn)行分析。在 4℃下保存微球，在 0、6和 12 周對(duì)樣本進(jìn)行測(cè)定。在分樣之間基因表達(dá)具有很強(qiáng)的相關(guān)性，表明儲(chǔ)存 cDNA 具有極小的批次效應(yīng)和較高的穩(wěn)定性。