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Replication-competent AAV Serotype 2 (rcAAV2) Detection Kit

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詳細(xì)介紹

 

中美歐三國監(jiān)管機(jī)構(gòu)對于復(fù)制型病毒的控制階段和檢測要求基本相同,在產(chǎn)品生產(chǎn)的各個階段以及在接受基于病毒載體的基因治療的患者后續(xù)監(jiān)測中進(jìn)行檢測。并且各監(jiān)管機(jī)構(gòu)推薦的復(fù)制型病毒的檢測方法均是指示細(xì)胞培養(yǎng)法,該方法是復(fù)制型病毒檢測的金標(biāo)準(zhǔn)。

在重組腺相關(guān)病毒(rAAV)載體生產(chǎn)過程中,轉(zhuǎn)染用質(zhì)粒DNA與rAAV會由于物理接近而導(dǎo)致rAAV載體基因組、Rep/Cap基因以及ITR序列發(fā)生非同源重組,這些重組序列被誤包后就形成了具有復(fù)制能力的AAV,即復(fù)制型腺相關(guān)病毒(rcAAV)。

目前,rcAAV檢測常采用2種方法:基于細(xì)胞培養(yǎng)的檢測方法和qPCR快檢法(直接檢測法)。

FDA的指導(dǎo)原則建議通過全面的質(zhì)量研究確認(rèn)產(chǎn)品的關(guān)鍵質(zhì)量屬性,由于下述rcAAV的兩種檢測方法各有優(yōu)缺點,可考慮同時采用原理互補(bǔ)的不同方法進(jìn)行研究。

  • 基于細(xì)胞培養(yǎng)的檢測方法

通過不斷的細(xì)胞傳代使rcAAV實現(xiàn)擴(kuò)增,之后再利用qPCR或Southern-blot方法進(jìn)行檢測,保證檢測到的rcAAV都具有復(fù)制能力,是目前最常用的檢測方法。

但是該方法也有它的缺陷:檢測靈敏度依賴于AAV不同血清型對靶細(xì)胞的感染效率,檢測值可能低于實際值;培養(yǎng)方法和檢測平臺建立也有難度,需建易感細(xì)胞株、輔助病毒庫等,耗時長且投入成本較高。

  • qPCR快檢法(直接檢測法)

rAAV原液或終產(chǎn)品提取核酸后,直接利用qPCR法檢測rcAAV,靶標(biāo)基因一般為ITR、Rep、Cap等的連接序列,可實現(xiàn)對rcAAV上兩種基因的檢測,提高準(zhǔn)確性。

其缺點為:檢測片段短,不能保證檢測目標(biāo)具備rcAAV復(fù)制所需完整序列,導(dǎo)致檢出的rcAAV不一定有復(fù)制能力,檢測值相較實際值偏高。

因此,針對rcAAV的檢測開發(fā)一款既能用于細(xì)胞培養(yǎng)后的終點檢測,也能用于rcAAV直接檢測的qPCR試劑盒,對于實現(xiàn)兩種檢測方法的互補(bǔ)驗證非常有必要。

針對上述情況,翌圣生物自主研發(fā)了復(fù)制型腺相關(guān)病毒血清型2 (rcAAV2)檢測試劑盒,基于熒光探針定量PCR原理,采用qPCR法分別檢測rAAV末端重復(fù)序列(ITR)(即參考基因Reference)和rcAAV的連接序列(即靶基因Target),實現(xiàn)對rAAV和rcAAV的同時定量檢測。還研發(fā)了與之配套使用的宿主細(xì)胞殘留DNA樣本前處理試劑盒,以及配套的自動化核酸提取儀器。用于定量分析檢測各種使用AAV2血清型的重組腺相關(guān)病毒載體進(jìn)行基因治療、腫瘤治療及疫苗研發(fā)等產(chǎn)品中可能發(fā)生的復(fù)制型腺相關(guān)病毒(rcAAV)的潛在風(fēng)險。

產(chǎn)品資質(zhì):  

符合法規(guī):按照EP2.6.7、JP G3和USP 63藥典要求驗證,符合國際權(quán)威機(jī)構(gòu)的標(biāo)準(zhǔn);

配合審計:產(chǎn)品生產(chǎn)符合ISO13485質(zhì)量體系標(biāo)準(zhǔn),有完善的審計文件;

保障品質(zhì):試劑盒所需酶原料全自產(chǎn),且已產(chǎn)業(yè)化,供貨穩(wěn)定;

技術(shù)經(jīng)驗積累:TaqMan法有技術(shù)沉淀,使得Kit靈敏度高;

專注產(chǎn)品性能:Taq酶抗體庫,雙封閉抗體提高了Kit特異性、穩(wěn)定性等。

 

產(chǎn)品特點:

抗干擾性:針對復(fù)雜基質(zhì),樣本加標(biāo)回收率至少能達(dá)70-130%;

靈敏度高:定量下限(LLOQ)為2copies/μL,檢測下限(LLOD)為0.125copies/μL;

精密度高:批內(nèi)重復(fù)性高CV<10%,批間差異小即中間精密度CV<15%;

專屬性強(qiáng):特異性檢測目的基因序列,不受其他外源基因組DNA干擾;

防干擾強(qiáng):引入內(nèi)部質(zhì)控(IC),可排除樣本干擾、反應(yīng)配制異常等,避免假陰性。

驗證完善:參考ICH Q2(R2)分析方法驗證指導(dǎo)原則,可提供完善的驗證報告。

 

驗證內(nèi)容:

rcAAV-2檢測驗證項目

參考標(biāo)準(zhǔn)or要求

備注

1、試劑盒標(biāo)準(zhǔn)品(參考品)

含有參考基因Reference和靶基因Target的質(zhì)粒DNA

 

2、線性范圍

標(biāo)曲范圍

參考說明書或?qū)嶋H情況(ReferenceTarget均是2×1012×106copies/μL

 

R2

≥0.98P.s.本試劑盒≥0.99)

藥典要求

斜率

-3.1~-3.8P.s.本試劑盒-3.1~-3.6

藥典要求

擴(kuò)增效率

90%~110%(P.s.對應(yīng)的斜率-3.1~-3.6,行業(yè)內(nèi)要求)

 

3、準(zhǔn)確性

回收率

50%~150%P.s.本試劑盒70~130%)

藥典要求

4、精密度

重復(fù)性

CV<10%

 

中間精密度

CV<15%

 

5、專屬性

不受其他來源基因組DNA的干擾

 

6、靈敏度

定量限

ReferenceTarget均是2copies/uL

 

檢測限

ReferenceTarget均是0.125copies/uL

 

7、耐用性

儀器適用性

Thermo:ABI 7500、ABI QuantStudio5;

Bio-Rad:CFX96 Optic Module;

上海宏石:SLAN-96S.

 

8、穩(wěn)定性

加速穩(wěn)定性

37℃穩(wěn)定14天,2~8℃穩(wěn)定30天

 

反復(fù)凍融

≥10次

 

有效期

-25~-15℃保存2年

 

9、空白限

無模板對照(NTC)

重復(fù)48qPCR擴(kuò)增曲線CT≥40

 

陰性抽提對照(NCS)

重復(fù)48qPCR擴(kuò)增曲線CT≥40

 

 

產(chǎn)品信息:

產(chǎn)品

貨號

品名

規(guī)格

樣本前處理

試劑盒

18461ES

MolPure® Magnetic Residual DNA Sample Preparation Kit

磁珠法殘留DNA樣本前處理試劑盒(瓶裝)

25T/100T

18467ES

MolPure® Mag48 Sample Preparation Kit FN

磁珠法48孔樣本前處理試劑盒FN(預(yù)封裝)

3×16T/

6×16T

核酸提取儀器

80511ES

48通道自動化核酸提取儀

48通量

 

rcAAV-2檢測試劑盒

41327ES

Replication-competent AAV Serotype 2 (rcAAV2) Detection Kit

復(fù)制型腺相關(guān)病毒血清型2 (rcAAV2)檢測試劑盒

50T/100T

 

 

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