CHO宿主細(xì)胞DNA殘留檢測試劑盒是用于定量分析檢測各種生物制品的中間品、半成品和成品中的CHO殘留DNA含量的試劑盒。

本試劑盒采用探針法熒光定量PCR原理，可專一快速的檢測CHO細(xì)胞的殘留DNA，其最低檢測限可以達(dá)到fg水平。該試劑盒可與本公司的磁珠法殘留DNA樣本前處理試劑盒（Cat#18461ES/18462ES）配套使用。

 

產(chǎn)品組分

組分編號	組分名稱	產(chǎn)品編號/規(guī)格
		41301ES50（50T）	41301ES60（100T）
41301-A	CHO qPCR mix	1 mL	2 mL
41301-B	DNA Dilution Buffer	2×2 mL	4×2 mL
41301-C	CHO DNA Control（30 ng/μL）	25 μL	50 μL

【注】：本試劑盒不含ROX參比染料，若您目前使用的Real Time PCR擴增儀需要添加ROX參比染料，推薦您購買本公司的50× ROX Reference Dye（Cat#10200ES）。

 

運輸和保存方法

1.所有組分均干冰運輸，-20℃保存，有效期2年。

 2. 收到貨后，請檢查共3個組分是否齊全，并立即放入對應(yīng)的保存溫度中儲存。

 

注意事項

1. 使用本試劑前請仔細(xì)閱讀本說明書，實驗應(yīng)規(guī)范操作，包括樣本處理、反應(yīng)體系的配制及加樣。

2. 加樣和配液步驟盡量都在冰上操作。

3. 每個組分在使用前都應(yīng)充分震蕩混勻，低速離心。

4. 為了您的安全和健康，請穿實驗服并戴一次性手套操作。

5. 本產(chǎn)品僅作科研用途。

 

適用機型

包含但不限于以下儀器：

Bio-Rad：CFX96 Optic Module；

Thermo Scientific：ABI 7500；ABI Quant Studio 5；ABI Step OnePlus.

 

使用方法

一、CHO DNA定量參考品的稀釋和標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備

用試劑盒中提供的DNA稀釋液將DNA定量參考品進行梯度稀釋，稀釋濃度依次為300 pg/μL、30 pg/μL、3 pg/μL、300 fg/μL、30 fg/μL、3 fg/μL。

具體操作如下：

1. 將試劑盒中的DNA 定量參考品和DNA稀釋液置于冰上融化，待完全融化后，輕微振蕩混勻，低速離心10 sec。

2. 取7支潔凈的1.5 mL離心管，分別標(biāo)記為 3 ng/μL，①，②，③，④，⑤，⑥。

3. 在標(biāo)記為3 ng/μL的1.5mL離心管中加入90 μL DNA 稀釋液和10 μL DNA 定量參考品（30 ng/μL），即稀釋為3 ng/μL，振蕩混勻后短時間快速離心10 sec，該濃度可分裝置于-20℃短期保存（不超過3個月），使用時避免反復(fù)凍融。

4. 在 ①，②，③，④，⑤，⑥ 管中先分別加入90 μL DNA稀釋液，再進行梯度稀釋，稀釋方法如下：

稀釋管	稀釋比例	終濃度
①	10 μL 3 ng/μL+90 μL DNA 稀釋液	300 pg/μL
②	10 μL ①+90 μL DNA 稀釋液	30 pg/μL
③	10 μL ②+90 μL DNA 稀釋液	3 pg/μL
④	10 μL ③+90 μL DNA 稀釋液	300 fg/μL
⑤	10 μL ④+90 μL DNA 稀釋液	30 fg/μL
⑥	10 μL ⑤+90 μL DNA 稀釋液	3 fg/μL

【注】：

1. 每個濃度做3個復(fù)孔，該試劑可測試3 fg/μL-300 pg/μL線性范圍。若需要，可適當(dāng)擴大或縮小線性范圍。

2. 為減少反復(fù)凍融次數(shù)和避免污染，建議初次使用時將DNA定量參考品分裝儲存于-20℃。

3. 已融化未使用的 DNA 稀釋液可保存于2-8 ℃ 7天，若長時間不用，請放置于-20℃。

4. 為確保模板完全混勻，每個梯度稀釋時需輕微震蕩混勻約1 min。

二、樣本加標(biāo)回收質(zhì)控QC的制備

根據(jù)需要設(shè)QC中的CHO DNA標(biāo)準(zhǔn)品濃度（以制備加3 pg/μL DNA量的樣本加標(biāo)回收為例），具體操作如下：

1. 取100 μL待測樣本加入1.5 mL潔凈的離心管中，再加入10μL 溶液③，混勻，標(biāo)記為加標(biāo)回收QC。
2. 加標(biāo)回收QC和同批待測樣本一起進行樣本前處理，制備加標(biāo)回收QC純化液。

三、標(biāo)準(zhǔn)品回收質(zhì)控QC的制備（可選）

根據(jù)需要設(shè)QC中的CHO DNA標(biāo)準(zhǔn)品濃度（以制備加3 pg/μL DNA量的標(biāo)準(zhǔn)品回收為例），具體操作如下：

1. 取100 μL 溶液③加入1.5 mL潔凈的離心管中，標(biāo)記為標(biāo)準(zhǔn)品回收QC。
2. 標(biāo)準(zhǔn)品回收QC和同批待測樣本一起進行樣本前處理，制備標(biāo)準(zhǔn)品回收QC純化液。

四、陰性質(zhì)控NCS的制備

根據(jù)實驗設(shè)置陰性質(zhì)控，具體操作如下：

1. 取100 μL樣本基質(zhì)溶液（或DNA 稀釋液）加入1.5 mL潔凈的離心管中，標(biāo)記為陰性質(zhì)控NCS。
2. 陰性質(zhì)控NCS和同批待測樣本一起進行樣本前處理，制備成陰性質(zhì)控NCS純化液。

五、無模板對照NTC的制備

根據(jù)實驗設(shè)置無模板對照NTC，具體操作如下：

1. 無模板對照NTC無需進行樣本前處理，在qPCR法檢測殘留DNA含量階段開始配置即可。
2. 每管或孔中的NTC樣本為20 μL CHO qPCR Mix + 20 μL DNA Dilution Buffer，建議配置3個重復(fù)孔的量。

六、反應(yīng)體系

組分	體積（μL）
CHO qPCR Mix	20
DNA template	20
總體積	40

【注】：

1. 根據(jù)反應(yīng)孔數(shù)計算本次所需的qPCR Mix總量：qPCR Mix =（反應(yīng)孔數(shù)+2）×20 μL（含有2孔的損失量）。通常，每個樣本做3個重復(fù)孔。

2. 加樣完成密封好管子后，請先低速離心10 sec將管壁的液體離心收集至管底，再震蕩混勻5 sec以上，完全混勻反應(yīng)液，再低速離心10 sec將管壁的液體離心收集至管底，如有氣泡，需將氣泡排盡。

下圖為參考板位：

該示例是對CHO殘留DNA qPCR法檢測操作的展示，檢測樣本包括：1個無模板對照NTC、6個濃度梯度的DNA標(biāo)準(zhǔn)曲線、3個樣本加標(biāo)回收QC、3個待測樣本、3個標(biāo)準(zhǔn)品回收QC（可選）、3個陰性質(zhì)控NCS（1個即可）。建議每個樣本做3個重復(fù)孔。

七、擴增程序參數(shù)設(shè)置（兩步法）（以Bio-Rad公司CFX 96 qPCR儀、軟件版本4.1.2433.1219為例）

1. 創(chuàng)建空白新程序，選擇絕對定量檢測模板。
2. 創(chuàng)建1個檢測探針，命名為“CHO-DNA”，選擇“run setup”欄中的“select run type”下方的“user-define”，在“run setup”界面中開始程序、板位、通道的設(shè)置：

2.1 首先，在“protocol”下點擊“Create New”開始設(shè)置PCR程序，設(shè)置好后點擊“OK”，保存程序文件。

2.2 點擊“Next”或者“plate”進入孔位設(shè)置界面，點擊“create new”，在“Scan Mode”中可以選擇“All Channels”或者“SYBR/FAM Only”選項。用鼠標(biāo)勾選反應(yīng)格，點擊“select fluorophores”選項，勾選“FAM”后點擊“OK”，在“sample type”選項下選擇“unknow”（或其他樣本類型），勾選“target name欄下的“load”右邊的框，同時根據(jù)個人需求設(shè)置“target name”，也可不設(shè)置。根據(jù)個人需求在選項“Sample names”和“Biological Group”中輸入樣本名稱和組別，也可不設(shè)置。點擊“OK”保存好最后的結(jié)果文件。

2.3 點擊“Next”或“Start run”，開始儀器運行。

3. 擴增程序設(shè)置：設(shè)置反應(yīng)體積40 μL。

循環(huán)步驟	溫度（℃）	時間	循環(huán)數(shù)
預(yù)變性	95 ℃	5 min	1
變性	95 ℃	15 sec	40
退火/延伸（收集熒光）	60 ℃	30 sec

八、qPCR 結(jié)果分析

1. 上機結(jié)束后，在程序的右上角點擊“plate setup” 欄下的“view/edit plate”，選中標(biāo)準(zhǔn)品的反應(yīng)格，在右側(cè)的“sample type”欄下選擇“standard”，設(shè)置好每個梯度的重復(fù)孔，在“loda concentration”下輸入所做的濃度后按“enter”鍵確認(rèn)，依次將標(biāo)準(zhǔn)品的梯度設(shè)置完成。
2. 點擊“OK”，返回到初始界面，即可讀取標(biāo)準(zhǔn)曲線的R²、擴增效率（Eff%）、斜率（Slope）、截距（Intercept）等。正常的標(biāo)曲：R²＞0.99；擴增效率在90%≤Eff%≤110%范圍內(nèi)；Slope在-3.4左右。
3. 根據(jù)設(shè)置的樣本名稱和組別，讀取無模板對照NTC、陰性質(zhì)控NCS、待測樣本和樣本加標(biāo)回收等的檢測值，單位為fg/μL，后續(xù)可在檢測報告中將單位換算成pg/μL或pg/mL。

HB221226